En arrivant sur les lieux d'un accident d'avion, Jo, chef de la police, découvre une petite fille rescapée. Elle s'aperçoit rapidement que l'enfant ne se souvient pas de son identité et la recueille chez elle. En menant l'enquête pour découvrir d'où vient la fillette, elle se retrouve confrontée à une série de phénomènes mystérieux.

Alors que Jo continue de chercher des réponses à ses questions, l'arrivée d'un homme mystérieux en ville est susceptible de causer des problèmes. Piper tente de maîtriser ses nouvelles capacités en entrant en contact avec sa famille.

Une mysytérieuse maladie s'empare de Piper. Jo et Benny enquêtent sur Richard Kindred, un puissant magnat de la technologie. Jo envisage la possibilité d'accepter l'aide d'une source inconnue. Alex tente de déchiffrer un code de fréquence radio lié à l'écrasement d'avion dans lequel se trouvait Piper.

Après en avoir appris plus sur les origines de Piper, Jo doit prendre les bonnes décisions pour la protéger.

Jo est déterminée à prouver que Kindred était à l'origine de l'attaque de Benny et April. Piper a des visions intenses et déroutantes.

Jo et Benny enquêtent sur la mort de l'ancien associé de Kindred. Mia aide Piper à découvrir l'étendue de ses pouvoirs. Alex souhaite comprendre pourquoi Ed est choisi pour mourir.

Alors que la famille est à fleur de peau après avoir appris son secret, Piper traverse un moment difficile. Emily en profite pour prendre l'avantage sur elle.

Le FBI arrive à Southold compliquant ainsi les efforts de Jo pour retrouver Emily. Pendant ce temps, Alex et Piper cherchent des réponses à leurs questions lors d'un voyage en voiture. La famille fête l'anniversaire de Mia.

Jo et Chris doivent échapper au FBI durant leur enquête sur des cyber-terroristes. Ed suit un traitement pour son cancer qui semble trop performant pour être vrai. Une mystérieuse femme met Piper et la famille Evans en danger.

La famille Evans reçoit des informations susceptibles de les conduire à Piper. Jo et Brooks suivent cette piste. Ed aide Mia en essayant d'envoyer un message à Piper tandis qu'Alex et Chris tombent sur une mystérieuse cargaison au port.

En essayant d'entrer en communication avec Piper, Jo et Brooks rejoignent une équipe improbable. Pendant ce temps, Piper a l'intention de sauver Benny de la mystérieuse mission d'Helen. Alex reçoit une proposition qui pourrait changer sa vie.

Jo prend de grands risques pour arrêter Helen et mettre Piper en sécurité. Pendant ce temps, Helen tente de reproduire les pouvoirs de Piper à ses fins et Benny a du mal à regagner la confiance de Jo avant qu'il ne soit trop tard.

Jo et Brooks sont en danger mais Piper est déterminée à les aider. Le mystérieux plan d'Helen étant presque réalisé, Piper recrute une équipe inattendue d'alliés pour les retrouver avant qu'il ne soit trop tard.